Diego Agra de Souza
Integração de dados de single cell RNA no Adenocarcinoma de pulmão EGFR mutados e não mutados.
Resumo
Introdução: O status mutacional do EGFR pode influenciar o microambiente tumoral do adenocarcinoma pulmonar (LUAD), mas seus efeitos multicelulares permanecem incompletamente compreendidos. O estudo teve como objetivo caracterizar alterações celulares, transcriptômicas, funcionais e de comunicação intercelular associadas ao status do EGFR. Métodos: Foram integrados dados públicos de RNA-seq de célula única de 21 pacientes com LUAD provenientes de três estudos independentes, incluindo 13 tumores EGFR-mutados e oito EGFR não mutados, totalizando 64.369 células. Foram avaliadas a composição celular por paciente, a expressão diferencial por pseudobulk com edgeR, o enriquecimento funcional e a comunicação intercelular por CellChat, seguidos de integração multicamada das evidências. Resultados: A composição das principais populações celulares não diferiu significativamente entre os grupos. Entretanto, foram identificadas alterações transcriptômicas dependentes do tipo celular e programas funcionais associados ao EGFR. A integração revelou 380 genes convergentes organizados em quatro programas relacionados ao remodelamento tecidual, matriz extracelular, imunidade adaptativa e sinalização inflamatória, além de 14 genes convergentes de alta confiança. TNFSF12 (TWEAK) integrou o conjunto de alta confiança, enquanto TNFRSF12A (Fn14) integrou o conjunto mais amplo de genes convergentes, destacando o eixo TWEAK–Fn14 como hipótese translacional. Em análise dirigida do compartimento tumoral, a expressão de TNFRSF12A correlacionou-se positivamente com CD274 (PD-L1) e com um módulo transcricional de NF-κB canônico entre os tumores EGFR-mutados. Conclusão: O status do EGFR está associado a estados funcionais multicelulares distintos no LUAD, apesar da composição celular global semelhante. A integração multicamada forneceu uma estrutura rastreável para organização das evidências e priorização de candidatos. O eixo TWEAK–Fn14 emergiu como hipótese translacional, enquanto a associação entre TNFRSF12A, PD-L1 e NF-κB canônico no estrato EGFR-mutado definiu uma hipótese imunorregulatória adicional para validação funcional.